胞外產物

發酵液可采用連續流離心機分離出微生物。為了增加收益率，對固體進行再次洗滌，并使用離心法再次進行分離。兩次分離得到的上清液混合后進入后續工藝。對該封閉式加工工藝中產出物必須在（至少） 121°C的環境下進行滅菌。

胞內產物及包涵體

在胞內工藝中，所需產物在胞內液體中或包涵體中是大不相同的。與胞外物生產相比，不同的是固液兩相分離后收集生物菌體進行再處理。經過洗滌和濃縮后的生物菌體,采用高壓均質機進行細胞破碎，釋放出胞內液體和包涵體。再采用麥煌離技高速分離機，將細胞碎片與胞內液、包涵體分離，得到的所需產物可通過連續運行的分離機再次分離出固體。